Au cœur de la plaine de la Beauce, le site de Moronville siège dans le fond de vallon de la Branche de Fontenay, cours d’eau intermittent creusé en amont de la source de la rivière Conie. Il héberge un ensemble de milieux se développant en partie sur un marais atterri s’immergeant par remontée de la nappe de Beauce et se ramifie par une vallée sèche, la Vallée de Vauboyau. Géré par le Conservatoire, il est la propriété de l’AGFCM (Association de Gestion Forestière et Cynégétique de Moronville).